主题:你的电脑将会造福人类——谈谈分布式计算
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2001年07月20日 10:10 新浪科技

  新浪 阿逊:美国宾夕法尼亚州波科诺山一家普通乡村旅店的地下室,日夜灯火通明,老板迈克·凯利的数台电脑不停运转着,沙沙作响。虽然表面没什么特别,但其实这些电脑正在处理一个现代医学中的重大难题。

  凯利的5台电脑使用剩余的计算能力,分析着数亿个基因组成的庞大数据库,希望发现基因在艾滋病和癌症等疾病中所起的作用。一天下来,如果运气好的话,他可以掀起8至9个
基因的面纱。如果按照这个速度计算,他可以在数亿年后完成整个解析过程。

  不过不要紧张,因为凯利的同好遍天下,全球共有1万多台电脑加入了凯利所在的研究项目。这些电脑被因特网编织在一起,组成一个代用的超级计算机。仿佛浩浩荡荡的蚂蚁兵团啮食大象的尸体一样,这些电脑正在有条不紊地测试每一个潜在的基因。他们希望能够在大约两年时间内完成所有工作。

  凯利的电脑是这项雄心勃勃的分布式计算计划的根的部分。所谓分布式计算是指把计算分布到多个机器上去进行。利用数千万台个人电脑同时运转所产生的力量来创造虚拟超级计算机,以攻克现代科学中的尖端计算难题。凯利说:“全球目前有相当于一百万台Cray超级计算机的计算能力处于闲置状态,把它们调动起来,就可以减轻计算能力紧张的压力。”

  以往曾经有过分散的分布式计算项目,但并不红火。随着因特网的迅速传播和个人电脑计算能力日益增长,使这一领域内出现重大变化。科学工作者正在利用这一战略来与疾病作斗争,预测全球气候变化并预测股票市场内的变动。

  瑞典放射科学家彼得·詹森设计出一种算法,模拟测量一种小型核废料储存罐周围数千万个点的伽玛射线辐射量。如果最终获得答案,技术人员就可以知道一个罐子的最多储存量。然而,詹森的算法需要数十亿次计算,这项计算如果在在一台电脑上完成,需要大约5万年完成。而在2万名志愿者的电脑上运行该项目2年之后,对罐子的数据计算已经基本完成。杰森说:“计算很简单,只是整个过程的计算量太大。”

  分布式计算在某种程度上仍然是普通人很陌生的概念,因为目前参与的人仅有几百万,而访问因特网的用户则高达数亿人。但这种概念正在迅速横扫网络世界,并产生了一种特殊的的技术文化,这种文化把慈善、高科技和电脑游戏混合在一起。

  参与者已经形成激烈竞争的计算小组,成为因特网上的团队运动。弗吉尼亚州阿灵顿的网络开发商亨利·斯坦波斯十分钟情分布式计算的,他收集了一批废弃电脑以提高他在分布式计算项目上的排名。斯坦波斯说:“你看到你的名字,然后你会说,我要把我的名字排在最上面。”斯坦波斯是计算股票市场波动性项目的志愿者,同时参与研究蛋白质如何从线型的氨基酸的形式转换成三维形状。

  分布式计算的概念从网络计算的早期就已经出现。这一概念早在最早诞生在20世纪70年代的施乐公司帕洛阿尔托研究中心。那里的网络科学家们创造了一个名为“蠕虫”(worm)的程序,该程序在研究中心的200多台机器上漫游,目的是用来搜索可投入使用的闲置电脑。这一项目后来演变成一场灾难,蠕虫可以运行导致系统瘫痪的测试程序,当某一主机下辖的每一台电脑都瘫痪后,蠕虫程序又扩展到一个新的主机上,使它瘫痪。今天提起蠕虫,大多数人已经忘记了这其实是分布式计算的起源,而只记得它是一种破坏性极强、自我传播快的电脑病毒,类似于去年的“爱虫”病毒。

  分布式计算的概念此后一段时间里进入冬眠期,到90年代中期因特网开始普及、数百万台电脑可以通过一个单一的网络相连接时,分布式计算的概念又开始复兴。科学家开始推出各种质数研究和解密工作,这些计算工作是专为这种方式而设计的,因为这些计算简单,但计算次数却大到难以想像。

  最终将分布式计算带到大众面前的是一个名为SETI@home的狂想家项目。加州大学伯克利分校领导的工作支持搜索外星智能,让个人电脑用户研究来自波多黎各Arecibo天文台射电望远镜的数据,来搜索可能是来自于先进文明的不寻常信号。

  尽管不少严肃的科学家怀疑这类项目是否能发现什么东西,但截取外星人通讯的前景那么引人着迷,在推出短短2年内就有300多万志愿者下载了SETI@home的数据计算屏保程序。

  现在,各大领域内的研究学者们都陆续推出类似SETI@home,但更具备使用目标的程序。斯坦福大学化学教授维杰·潘德正在领导Genome@home的项目,正是这个项目占据了凯利在波科诺山旅店的电脑。在18000名志愿者的帮助下,他同时还在运行一个相关项目,一毫微秒、一毫微秒地模拟蛋白质在形成三维形状时的行为。

  每天,一个志愿者的电脑可以计算大约10亿分之一秒的一个蛋白质的形成过程。如果18000台电脑都在运行的话,大约需要三个星期就可以获得一些有价值的结果,然后他们就可以开始研究另一组蛋白质。

  位于England的Oxfordshire的Rutherford Appleton实验室的气象动态研究学家迈尔斯·阿艾则试图预测2050年的全球气候。今年夏天,阿艾向17000多名志愿者发放各种气候预测模型,每一个计算模型人至少需要在一台台式电脑上计算200天。分布式计算使阿伦可以模拟数千个方案,评估包括气温等100多个参数对全球气候的影响。在一台超级计算机上,他仅可以运行大约12个方案。

  这些研究项目已经开始获得成果。约95000名志愿者组成的一个团体赢得了数项加密竞赛的大奖并且发现了新的质数。斯坦福大学的潘德教授已经根据正在进行的研究蛋白质的试验结果,在《科学》杂志上发表了两篇论文。在La Jolla的Scripps研究学会,一个名为FightAIDS@home的项目已经加快了对治疗艾滋病药物的检查速度。

  但除了这些实际收益之外,在这个网上色情内容日增、诈骗和大量垃圾邮件堆积的时代,真正推动这项运动的是一种利他主义和科学研究的精神,以及重新回到纯净的早期因特网时代的渴望。

  参与Genome@home项目的志愿者斯蒂夫·泰勒说:“癌症使我失去了双亲,我把参与这项计划看作是‘做自己的一点贡献’,来抵抗癌症和其它可怕的疾病。”

  泰勒为该项目购置了6台电脑。他说:“我发现这样做比起把钱放在慈善机构的信封里、然后不知所终更有成就感。”

  为了参加一个分布计算项目,普通的电脑用户志愿者需要下载一个小程序。这个程序将负责计算、与服务器通讯以发送用于处理的大量数据。这个程序的目的是利用电脑闲置时的资源,因此用户使用电脑时,这个程序就会降低运行速度,而在电脑闲置时就会加快。

  一家成立4年的非盈利研究基金会Distribted_net专门致力于推动分布式计算。基金会负责人戴维·马克奈特说:“电脑闲置资源不能储存,没有充分利用的话就白白浪费了。如果能找到一个很好地使用这种资源的途径,将非常令人激动。我希望能够充分利用这些资源。”

  但正如因特网逐渐从纯洁的象牙塔走向市场,商业利益已经走近分布式计算领域,并且因此推动了这一过程。

  免费因特网服务供应商Juno网上服务公司最近提出一些苛刻条件,要求客户不能关闭电脑,这令其客户非常不满。这家公司希望借此向研究机构和其它公司出售处理能力,以获取利润。

  许多新兴公司正在组织自己的分布式计算电脑网络,通过抽奖和提供现金回扣等措施吸引志愿者加入。弗吉尼亚州Fairfax的Parabon计算公司计划根据人们为网络贡献的计算能力,提供一定报酬。其首席执行官斯蒂夫·阿姆特朗估计,一台高端工作站一年可收入500美元。

  但是对大多数志愿者而言,吸引他们的不是钱,而是最终的结果。数据库管理者米歇尔·霍特克对于他在SETI@home里的排名无法上升备感沮丧。这项排名是根据他们为该项目做了多少工作列出的。其实这种排名和与网上游戏排名相比并没有多大区别,但对于参与者而言,这种排名是一项非常重要的荣誉。霍特克最终决定退出SETI@home项目,而转而加入另外两项更新的项目,原因就是这两个项目提供更高的排名机会。他加入了FightAIDS@home的团队项目,并成功地进入了前100名;接着他又加入了英特尔公司和位于德克萨斯州奥斯丁的联合设备公司赞助的癌症研究项目,并迅速上升到第八位。霍特克说:“如果我发现了一些东西,就是发现了一些东西,但我更感兴趣的是获得更高的分值、更高的排名。”住在俄亥俄州的霍特克,一天到晚开着电脑,他的观点是:“如果我现在用不着它,还不如让它开着做些有用的事。”这场竞争已经有些白热化,一些项目明显是针锋相对。

  文章开头提到的旅店老板凯利是Overclockers Network Hellspawns团队的一名成员。这个团队大约有65名成员,从技术专业人员到高校学生不等,最近超过了另外一个以Star Trek中的角色Jean-Luc Picard船长为名的团队,在斯坦福大学的基因合成项目中排名升为第三。

  现在他们已经接近另外一个意大利团队,那个团队比他们多计算出2000多个基因。这大约需要Overclockers花费5天的时间来赶超他们。凯利说,他的团队正在拼命追赶,团体成员在办公室里争取有用的电脑计算时间,此外一些因特网网吧也被拉入这项工作。该团队的一位成员正在写一种SETI@home类型的屏保程序,来吸引更多的人支持。尽管意大利的团队保持领先,但凯利有信心赶上他们。这样的话就只剩下Ars Technica Team Primordial Soup团队,这支排名第一的团队比他们领先12400个基因。凯利明白,赶上他们的机会渺茫。凯利说:“他们就象庞然怪兽,有数万名成员,比我们多太多了。”

[wlingjie 编辑于 2006-11-14 00:42]

[2006-11-14 01:23 补充如下]

分布式计算为什么?
分布式计算安全吗?
分布式计算有哪些?
如何参与各个项目?

[2006-11-14 11:43 补充如下]

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目前各大公司已经受不了了, 每年在电费上的花费实在太高. 所以yahoo等公司才告诉
Intel: 不要再盲目追求高性能,要想法降低功耗.

美国有些使用大型分布式系统的公司,每年的运行成本竟然75%是电费.

原文由 jxsq 发表
几年前的数据了, 新机器上用电更厉害.
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ms这个咚咚比较有商业前途哦。

原文由 云漫 发表
这几年做Distributed Computing :-)

不过我不做算法,作infrastructure...
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几年前的数据了, 新机器上用电更厉害.

http://windows.uwaterloo.ca/Hardware/PC_Power_Consumption.asp

According to tests conducted by IST, Hardware Support, tests showed the following. On a Pentium 4, 1.7GH machine:

    * during boot power in watts is close to 110w
    * during idle, no power management,. close to 60w
    * during full power saving, no hard disk spin, machine in sleep mode, 35w

The monitor consumption was not included in these tests. Also, number will vary depending on the processor you have and what other peripherals you may have connected.


区别是50W (idel) - 75W (power saving mode)

算算看吧.
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在这里说负面的话, 似乎不得人心, 多有得罪了.

原文由 云漫 发表
我也支持大家去参与啊,...


实际上我想说的是: 我支持大家去参与研究, 严重反对大家去参与计算.

研究算法的应该知道, 减少算法复杂度, 比(线性)增加CPU数量好的多. 通信和数据是grid computing的软肋. 早期叫utility compouting, 现在不这么叫了, 是因为数据比计算难搞的多.

再想想, 如果分布式是应用的设计者, 需要付参与者一点点费用, 比如电费, 还有多少会设计者继续干? 对他们没有节制, 他们怎么会去想更好的算法. 很多东西, 根本就是吵作! 他们需要的, 仅仅是一个参与者数目, 浪费了无数宝贵资源后.

能源,资源是大家的, 珍惜吧.
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这几年做Distributed Computing :-)

不过我不做算法,作infrastructure...

原文由 beowulf 发表
云兄是哪行的?
bio-x?
量化?
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云兄是哪行的?
bio-x?
量化?

原文由 云漫 发表
嘿嘿,“基本上没有太大的应用价值”是相对说法.目前科学计算所面临的问题千千万万,
此类算法所能解决的极少极少.而且从目前所提出的几个问题看,似乎新闻价值大于科学价值.

我也支持大家去参与啊,先说清楚了.只是从一个算是这一下行里的研究者的角度提示一下而已.
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两年内共有23万5千名成员,44万台终端设备参与计算。
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今天是WCG运行两周年,总计算时间已经有6万年了。

详情见:
http://www_worldcommunitygrid_org
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原文由 redknight 发表
很有意义。不过,有个问题我想知道,除了排名之外,我还能获得什么?
对于大多数的运算,都是由国外的一些机构发起运作的,我们免费的提供了计算资源,如果得到了结果,可否免费的回馈人类?我的问题虽然有些狭隘,可是很实际。


redknight兄,目前主持运算项目的机构都是非盈利性的,而且很多都会公开他们的计算结果,比如:
FAD@Home: http://www_find-a-drug_biz/malaria-frame.html

Distributed Folding:http://www_blueprint_org/proteinfolding/distributedfolding/distfold_results.html

Folding@Home:http://www_equn_com/folding/result.htm

另外,在每个项目的官方网站上也能找到他们当前进度和阶段性成果的信息。
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原文由 zda111 发表
下载了反爱滋的网格计算,让公司电脑为人类多做些贡献吧!反正晚上也不关机。


欢迎zda111兄。

我一直觉得公司企业的办公室内,公务机关,学校机房这些是CPU资源浪费最多的地方,咱们一起努力吧。
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原文由 beijingbing 发表
顶,

已经下载运行, cpu和内存都占用一些

其实大量使用内存的时候不多,比如做平面的时候,那时候可以关一下

感觉这个做法不错,人多力量大


欢迎beijingbing兄参与。

您下载的是World Community Grid的客户端吧,它运行的项目的确比较吃内存,一般都会在80~100M左右。

如果您的内存比较吃紧,推荐使用Boinc平台,计算Einstein@Home项目,它只需要不到10M的资源。

具体操作方法请参考这个帖子:http://www_equn_com/forum/viewthread.php?tid=10452&fpage=1
项目帖:http://www_equn_com/forum/viewthread.php?tid=3089&fpage=1
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很有意义。不过,有个问题我想知道,除了排名之外,我还能获得什么?
对于大多数的运算,都是由国外的一些机构发起运作的,我们免费的提供了计算资源,如果得到了结果,可否免费的回馈人类?我的问题虽然有些狭隘,可是很实际。
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嘿嘿,“基本上没有太大的应用价值”是相对说法.目前科学计算所面临的问题千千万万,
此类算法所能解决的极少极少.而且从目前所提出的几个问题看,似乎新闻价值大于科学价值.

我也支持大家去参与啊,先说清楚了.只是从一个算是这一下行里的研究者的角度提示一下而已.

原文由 beowulf 发表
“基本上没有太大的应用价值”是太刻薄了点。
不过也不算非常的错,这和个人的立场是有关的。

支持你。
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原文由 beowulf 发表
“基本上没有太大的应用价值”是太刻薄了点。
不过也不算非常的错,这和个人的立场是有关的。

支持你。


谢谢beowulf兄。

原来您是研究Beowulf集群运算的。欢迎常来聊聊,也让大家能够※※※※的运算技术。
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下载了反爱滋的网格计算,让公司电脑为人类多做些贡献吧!反正晚上也不关机。
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原文由 beowulf 发表
成千上万的应用是不能这样做的。
分布式计算很有意义,但是少数例外上的引号没必要加上。
另外这也绝对不是计算科学的主流发展方向。

http://www_beowulf_org
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顶,

已经下载运行, cpu和内存都占用一些

其实大量使用内存的时候不多,比如做平面的时候,那时候可以关一下

感觉这个做法不错,人多力量大
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“基本上没有太大的应用价值”是太刻薄了点。
不过也不算非常的错,这和个人的立场是有关的。

支持你。

原文由 wlingjie 发表
beowulf兄,我不同意分布式运算“基本上没有太大的应用价值”的观点,所以列举了各方面的几个项目,以说明它能够被应用在一个更为宽广的领域中。

即使分布式运算只能应用到部分科学研究中(如云漫兄所说的“少数例外”),但它对这些“少数”研究项目也还是有重大意义的。

另外,其他的科学研究的方式,以及计算科学的 ......
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beowulf兄,我不同意分布式运算“基本上没有太大的应用价值”的观点,所以列举了各方面的几个项目,以说明它能够被应用在一个更为宽广的领域中。

即使分布式运算只能应用到部分科学研究中(如云漫兄所说的“少数例外”),但它对这些“少数”研究项目也还是有重大意义的。

另外,其他的科学研究的方式,以及计算科学的主流发展方向并无关乎我们对目前正在进行的项目做出力所能及的贡献。大家共献一份力量。
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成千上万的应用是不能这样做的。
分布式计算很有意义,但是少数例外上的引号没必要加上。
另外这也绝对不是计算科学的主流发展方向。

原文由 wlingjie 发表

云漫兄,目前有很多“少数例外”的科学计算问题,知名的如下:

Folding@Home:研究蛋白质折叠,误叠以及相关疾病(阿兹海默症、疯牛病、可传播性海绵状脑病等);

FightAids@Home:不用解释了吧,看名称 ......
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这东西能fightaids? 有点不大相信。aids的攻克需要的仅仅是计算能力吗,真要是那样就不是问题了,届时自然有时用的计算机被生产出来。
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难得好帖。学习。
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欢迎三言二拍兄。大家一起发动更多志愿者。

我算WCG已经两年了,HPF项目想起来也算Rosetta的呢,核心程序一样的说。
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我也参与了Rosetta@Home计算,已经有半年了.

[三言二拍 编辑于 2006-11-15 22:18]
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此类所谓分布式计算,由于各个节点之间几乎不可能通讯,所以仅仅适合于极小一类科学计算问题(如素数分解). 绝大多数计算是不可能这样简单并行化的.

除了少数例外,基本上没有太大的应用价值.


其实,就目前得到应用的分布式运算项目而言,关键也只是在于您是否愿意捐献出自己空闲的运算资源。

如果您就是不愿意参加,那么即使今后p2p运算得到了应用和普及,那也还是白搭。
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此类所谓分布式计算,由于各个节点之间几乎不可能通讯,所以仅仅适合于极小一类科学计算问题(如素数分解). 绝大多数计算是不可能这样简单并行化的.

除了少数例外,基本上没有太大的应用价值.


另外,受hwd2000兄的指点,查阅了部分P2P的资料,P2P分布式并行计算将会是科学计算方式今后的发展方向,届时将克服“由于各个节点之间几乎不可能通讯”的缺点,得到更广泛和深入的运用。

Intel、Sun Microsystems、Microsoft……都是P2P运算无偿的积极支持者。

参考资料:
http://www_ppcn_net/n1251c1.aspx
http://x_discuz_net/416263/viewspace_23908.html
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此类所谓分布式计算,由于各个节点之间几乎不可能通讯,所以仅仅适合于极小一类科学计算问题(如素数分解). 绝大多数计算是不可能这样简单并行化的.

除了少数例外,基本上没有太大的应用价值.


云漫兄,目前有很多“少数例外”的科学计算问题,知名的如下:

Folding@Home:研究蛋白质折叠,误叠以及相关疾病(阿兹海默症、疯牛病、可传播性海绵状脑病等);

FightAids@Home:不用解释了吧,看名称就知道了;

Seventeen or Bust:寻找最小的谢尔宾斯基数 (Sierpinski numbers) ;

D2OL:Drug Design and Optimization Lab (D2OL)™,药物设计优化实验室工作目标是寻找治疗Anthrax(炭疽), Smallpox(天花), Ebola(埃博拉)和 SARS(非典型性肺炎)及其它一些潜在的极具破坏性的传染病的药物;

GIMPS:搜索梅森素数;

CPDN:模拟地球气候变化;

Africa@Home:帮助非洲发展中国家解决健康和环境问题,主要针对疟疾进行药物研究;

Distributed_net:寻找最简优化尺,密码破解;

LHC:帮助建立世界上最大的粒子加速器;

Rosetta@Home:寻找准确预测和设计蛋白质结构及聚合物的方法,将有助于研究员们寻找人类对付一些重大疾病的途径;

Stardust@Home:从星辰号飞船的收集器中寻找星辰;

Predictor@Home:通过研究蛋白质序列来预测蛋白质结构;

Grid_org该平台致力于癌症研究、炭疽病毒研究、天花病毒研究以及一个新兴的项目——人类蛋白质折叠(运行于 IBM 开发的世界公共网格计算平台WCG下);

Einstein@Home:研究验证爱因斯坦提出的引力波;

DIMES:未来的互联网是什么样?这个项目研究分布式互联网测量和仿真。

更多的项目http://www_equn_com/distributed/active.html有一一列举。

[wlingjie 编辑于 2006-11-15 21:19]
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此类所谓分布式计算,由于各个节点之间几乎不可能通讯,所以仅仅适合于极小一类科学计算问题(如素数分解). 绝大多数计算是不可能这样简单并行化的.

除了少数例外,基本上没有太大的应用价值.

原文由 wlingjie 发表

所以更不能从一个项目上来评价一种技术应用是否有价值,何况这些项目都需要长时间,浩如烟海的繁复计算,不是短期内就可以看到成果的。
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回复主题: 你的电脑将会造福人类——谈谈分布式计算
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